Protein Blast中Blastp/PSI-BLAST/PHI-BLAST区别与选择

说完blastn，接着说blastp~blsatp中也有三个不同的算法可以选择，如下：

blastp (protein-protein BLAST)就是简单地进行蛋白与蛋白的比对，寻找蛋白质相似序列；

PSI-BLAST (Position-Specific Iterated BLAST)叫做位点特异性迭代比对，它在蛋白质数据库中循环搜索查询蛋白质，所有前一次被psi-blast发现的统计显著蛋白质序列将整合成新记分矩阵，通过多次迭代比对，直到不再发现统计显著的新蛋白质；

PHI-BLAST (Pattern Hit Initiated BLAST)可以在搜索的时候限定蛋白质的模式（pattern），只给出包含此模式的比对结果。